第一阶段，从１９４１年５月至１９４２年２月，是全党整风的准备阶段。这一阶段的重点是党的高级干部学习马列主义理论，提高思想认识水平。毛泽东在延安高级干部会议上作了《改造我们的学习》的著名报告，论述了马克思列宁主义同中国革命实践相结合的原则，批判了主观主义学风，号召全党注重调查研究，树立理论和实际相统一的马克思主义作风，为开展整风运动作了思想动员。随后，党中央先后作出《关于增强党性的决定》、《关于调查研究的决定》，号召全党开展调查研究，坚持实事求是的原则，从思想、政治、组织上克服各种不良倾向和作风。
１９４１年９月１０日，中共中央政治局召开扩大会议，主要讨论党的历史上特别是土地革命战争后期，即１９３１年９月开始的领导路线问题。毛泽东作了反对主观主义和宗派主义问题的报告，分析和批判了党内对待马克思列宁主义教条主义的错误态度和学风，强调要从党的高级干部做起。会议经过认真的讨论，加深了对土地革命战争后期“左”倾冒险主义领导错误的认识。９月２６日，中央成立学习研究组，毛泽东任组长，王稼祥任副组长，各地也成立高级学习组，学习马克思列宁主义理论，总结党的历史经验教训，从政治路线上分清是非，统一认识。
第二阶段，从１９４２年２月至１９４３年１０月，是全党普遍整风阶段，着重组织党员干部学习马列主义，清理错误的思想方法和作风。１９４２年２月１日，毛泽东在中共中央党校举行的开学典礼上作了《整顿党的作风》的报告，提出整顿党风、整顿学习、整顿文风的号召。２月８日，毛泽东又作了《反对党八股》的报告。这两个报告深刻地阐明了整风运动的任务和方针，标志着全党整风运动的开始。４月３日，中共中央宣传部作出《关于在延安讨论中央决定及毛泽东同志整顿三风报告的决定》，对整风运动的目的、要求、方法和步骤作出明确的规定。决定了全党整风学习的２２个文件，其中包括毛泽东的《整顿党的作风》、《反对党八股》、《改造我们的学习》、《反对自由主义》、《关于纠正党内的错误思想》，刘少奇的《论共产党员的修养》，陈云《怎样做一个共产党员》等。
５月下旬，中共中央政治局成立中央总学习委员会，毛泽东任主任，领导整风运动。同时，中央直属机关、军委直属系统、陕甘宁边区系统、文委系统和中央党校都建立了学习委员会。
第三阶段，从１９４３年１０月至１９４５年４月，为总结历史经验阶段。这一阶段，全党高级干部对党的历史特别是对１９３１年到１９３４年的历史进行了讨论和总结。１９４４年３月初，周恩来到中央党校作《关于党的“六大”的研究》的报告，回答干部学习中争论的一些重要问题。４月和５月，毛泽东分别在中共中央西北局高级干部会议上和中央党校作了“学习问题和时局问题”的报告（即著名的《学习和时局》一文），对党的历史中涉及的一些重要问题作了结论。在深入讨论的基础上，１９４５年４月２０日，党的六届七中全会通过了《关于若干历史问题的决议》，对党内若干重大历史问题作了正式结论。这个决议的通过标志着整风运动结束。
